Resumen El café es uno de los cultivos agrícolas de mayor relevancia económica, social y cultural en Puerto Rico. Sin embargo, su productividad está amenazada por múltiples plagas que deterioran la calidad del grano y afectan la estabilidad de la industria. Un desafío fundamental en su manejo radica en identificar correctamente estos organismos, ya que sus características morfológicas suelen ser muy similares entre especies, especialmente en etapas larvales, lo que dificulta diferenciarlos a simple vista. Esta falta de precisión puede retrasar la implementación de estrategias de control efectivas e incrementar las pérdidas agrícolas. Ante este escenario, el DNA Barcoding surge como una herramienta esencial para confirmar con precisión la identidad de las plagas presentes en los cafetales. A través del análisis molecular, es posible detectar especies que pasan desapercibidas visualmente, identificar invasores nuevos o emergentes, e identificar posibles mutaciones para una